鑒於動植物防疫檢疫措施對國際農產品貿易有重要影響，相關之行政管理、法令規章、檢疫程序、邊境管理、技術研發以及與國際標準調和等工作，多涉及國際標準、諮商、合作以及技術交流等工作。我國自 2002 年 1 月 1 日加入世界貿易組織 ( World Trade Organization, WTO) 後，與各國間農產品貿易往來日趨頻繁，不僅是輸入農產品種類及數量的大幅成長，輸入國家地區亦逐漸擴增，各種疫病害蟲入侵的風險大增，必須在推動自由貿易的同時與保護國內農業生產安全間尋求雙贏之平衡點，爰積極參與 WTO 多邊場域之動植物防疫檢疫議題相關活動，確保我國之權益，包括 WTO SPS 委員會議、標準與貿易發展基金 (STDF) 、爭端解決案例、貿易政策檢討會議、新會員入會案等，並擔任我國 WTO SPS 議題之國家通知機構與查詢點，負責辦理 SPS 通知文件提送 WTO ，以及接受會員相關諮詢或評論。此外亦積極參與亞太經濟合作會議 (APEC) 及世界動物衛生組織 (WOAH) 等國際多邊組織相關活動，瞭解國際標準發展趨勢與各多邊場域重要議題，與國際接軌。